C’est au XVII°siècle que furent comblés les fossés protégeant les remparts de la ville pour aménager une large avenue, l’actuel cours Sextius. Le chanoine Jean- baptiste du Chaîne et son frère, président du Parlement, décidèrent de la création d’une paroisse pour ce faubourg faisant face à la porte des cordeliers. Les voyageurs et transporteurs y faisaient une étape entre Marseille et les Alpes.
En 1697, Jean et Laurent vallon reçoivent commande d’un couvent et d’une église dont les travaux se terminèrent en 1702. Son plan inhabituel en forme de croix grecque possède une indéniable parenté avec les deux précédentes réalisations des Vallon, les églises des Jésuites et des Prêcheurs. Des cinq coupoles initialement prévues, seuls, la nef centrale et le bas-côté sud ont été réalisés. Un bas-côté nord sera rajouté au XIX° siècle. C’est ici qu’a été célébré le mariage de Paul Cézanne avec Hortense Fiquet.